近年来，华侨大学根据《关于深化研究生教育改革的意见》（教研〔2013〕1号）和《关于完善研究生教育投入机制的意见》（财教〔2013〕19号）等文件精神，全面深化研究生教育改革，完善研究生质量保障体系建设，推进研究生教育内涵式发展。同时，配合研究生教育投入机制改革采取一系列措施加大研究生奖助力度，完善研究生奖助体系，资助和激励研究生把更多时间和精力投入到学习和科研中。
华侨大学新的研究生奖助体系主要由研究生优秀新生奖学金（最高8万）、研究生国家奖学金（最高3万）、研究生学业奖学金（最高1.8万）、研究生优秀论文奖励（最高5万）、研究生国家助学金（最高1.2万）、研究生“三助”岗位津贴、研究生国家助学贷款、研究生困难补助、其他社会捐赠奖助学金和专项奖助学金等组成。同时，为了有效提高研究生科研创新能力，设立了华侨大学研究生创新基金，包括研究生科研创新能力培育计划（每个项目资助经费最高5万）和优秀博士学位论文提升计划（每个项目资助经费最低15万）。此外，华侨大学高度重视并大幅度提高研究生学术交流的资助面和额度。据统计，新政策实施后，研究生在校期间获得的各类奖助金总额最高可达到26万以上，这将对提高研究生待遇，充分调动研究生学习和科研积极性，促进科研能力和综合素质的提高发挥积极作用。
华侨大学在多项研究生综合改革措施的推动下，研究生报考数量和质量逐年提高，连续几年均高于全国平均水平，位居福建省高校前列。同时，连续三次获得全国优秀博士学位论文提名奖，多人次在国内外知名刊物发表学术论文，研究生培养质量显著提升。
